神学科は「神学コース」と「キリスト教人文学コース」の２つのコースに分かれています。 「神学コース」は将来、教会の伝道者・牧師、キリスト教界の指導者などになることを志している学生のためのコースです。
「キリスト教人文学コース」はクリスチャンではない人にも広く開かれたコースで、キリスト教精神に基づいて社会に貢献できる人間を育成することを目的としています。
　神学科では学生の主体性を重んじるために、カリキュラムの多くの科目が選択科目となっています。 自分の関心や目的に応じて選択することで、モチベーションが高まります。また、旧約聖書・新約聖書を 深く学ぶに伴い、ギリシア語、ヘブライ語、ラテン語といった古典語や現代語学の英語、ドイツ語にも 触れることができ、語学力も修得できます。